注意脾胃、肾命、三焦，是李时珍摄生思维的特性。李时珍提议土为精力之母、肾命一体、命门为朝气之原，三焦为命门之用等要紧观念。脾胃为后天之本、水谷之海、气血生化之源。《内经》对脾胃的剖解、生理，以及脾胃病的病因病理、诊疗防备等均有精辟阐明。
李东垣在此底子上，联合期间布景，合并部分领会，在脾胃生理方面强调了与精力的干系，觉得人的性命重要仰仗精力的保护，而精力是靠脾胃充养的。李时珍在摄生方面，也很注意脏腑中的脾胃。有人解析了他60首健脾和胃类丹方，其遣方用药以润燥相济之机为目标，此中苍术操纵的频次最高，白术次之。他秉持东垣之意，强调脾胃的强弱直接干系到人之寿夭。
在此底子上，明白提议“土为精力之母”（莲藕）、“土者万物之母”（*精）的观念。该当说“土者万物之母”“土为精力之母”是李时珍对于脾胃学说的正确概括，即使五行当中以土为尊的观念在历代哲学、史学文件中不乏其说，但明白将土（脾胃）的名望抬高到“万物之母”“精力之母”的高度，更为突显了脾胃在培育精力、后天摄生中的要紧性。李时珍曾著《三焦客难》一书，特意辨难三焦学说，惜已亡佚。
李时珍遵奉“右肾为命门，属性为火”之说，同时进一步觉得命门、三焦、相火、肾是一个互有关连的成效单元。他觉得肾命一体，肾脏为先天之本、藏精之所，命门乃相火之主、朝气之原，而三焦为命门、相火之用。李时珍在《本草大纲》中对药物的详细阐释呈现了其对于肾命、三焦的思维。如他觉得入命门的药物有乌附、天雄、硫*、蜀椒、阳起石、蛇床、益智仁、桑螵蛸、补骨脂、韭子、葫芦巴、牵牛、胡桃仁、阿月浑子、莲实、芡实、沉香、乳香、淫羊藿、仙茅、知母等。
此中温补下焦命门阳虚时可用乌附、天雄；补命门真火不够可用硫*；温补右肾命门气分时可用蜀椒、阳起石、蛇床、益智仁；清命门相火多余时用知母。入三焦的药物有胡桃仁、淫羊藿、仙茅、益智、附子、木香、泽泻、胡麻、仙灵脾、乌桕皮、香附等；此中胡桃仁、木香利三焦；补三焦时可用仙茅、益智；逐三焦停水用泽泻；下三焦热*用胡麻；治三焦咳嗽用仙灵脾；治三焦约用乌桕皮。强调辨证，注意奇经八脉李时保注意奇经八脉在卫生、摄生中的奇特名望，所谓“医不知此，罔探病机；仙不知此，难安炉鼎”。这是李时保注意摄生，不同于时时医家、摄生家的场合，他看到了摄生的关键地方。
完竣奇经八脉辨证摄生注意奇经八脉，需明白奇经八脉无内外合做、并没有拘制于十二端方的特性，所谓“端方犹夫水沟，奇经犹夫湖泽”之理。端方之脉兴旺则溢于奇经，奇经在摄生学说表现着更为要紧的效用。李时珍撰写的《奇经八脉考》不单系统报告了八脉散布的途径，还联合八脉所主病证以及各家的论说，完竣了奇经八脉的辨证论治。在《本草大纲》中也指出了不少诊疗奇经八脉病证的用药。如入冲脉的药有术、当归、王不留行；升麻、芍药、艾、龙骨入带脉，此中升麻可缓其缩急；王不留行、水龟、绿毛龟、鹤入任脉；鹿、羊脊骨通督脉。此中在诊疗冲脉为病，逆气里急时用术、当归。因龟鹤能运任脉，鹿能通督脉，均为多寿之物。